Y-STR маркеры и Y-STR гаплотип

Y-STR маркеры — это участки ДНК на Y-хромосоме, которые содержат повторяющиеся последовательности нуклеотидов. STR — это сокращение от «short tandem repeats» (короткие тандемные повторы)

Они используются для анализа генетического профиля мужчин в мужской линии наследования. Количество повторов в этих участках может отличаться у разных людей, что позволяет создать уникальный генетический профиль для каждого человека. Сравнение генетических профилей мужчин с помощью Y-STR маркеров позволяет исследовать родственные связи между ними и установить историю миграций и происхождения различных групп населения.

Y-STR маркеры отличаются от других маркеров, используемых для генетического анализа, таких как STR маркеры на других хромосомах или митохондриальная ДНК, тем, что они наследуются только от отца к сыну в мужской линии наследования. Это делает их особенно полезными для изучения родства между мужчинами, у которых есть общий предок в мужской линии наследования.

Y-STR маркеры используются в различных областях, таких как генеалогия, археология, антропология и криминалистика. Они также помогают установить происхождение национальных и этнических групп, а также миграционные потоки, которые происходили в течение истории.

Каждый маркер имеет свое название, такое как DYS19 или DYS389, и определенное количество повторов, которое может быть унаследовано от предков.

Ниже пример 111 маркерной панели FTDNA. Первая панель относится к Y12 тестам. В Y37 включается 1-3. В Y67 1-4. В Y111 все 5 панелей.

FTDNA Y111
Y-STR маркеры и Y-STR гаплотип 2

Каждый такой Y-STR маркер локализован в пределах определенных координат в Y-хромосоме. Посмотреть эти координаты можно на сайте Ybrowse. Для этого достаточно дописать к https://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY/?name= название конкретного Y-STR маркера. Например:
https://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY/?name=DYS393

Y-STR гаплотип — это уникальный генетический профиль мужчины в мужской линии наследования, который определяется по количеству повторов определенных последовательностей нуклеотидов в определенных участках ДНК на Y-хромосоме.

Каждый Y-STR гаплотип может быть записан как набор чисел, соответствующих количеству повторов соответствующих Y-STR маркеров. Примеры Y-STR гаплотипов Y12 и Y37 представлены ниже:

Пример Y12 гаплотипа: 13-24-14-11-11-14-12-12-12-13-29-17

Пример Y37 гаплотипа: 13-24-14-11-11-14-12-12-12-13-29-17-9-10-11-11-25-15-19-29-15-15-16-17-11-12-21-14-16-16-19-9-10-11-12-12

Как видно из примеров, Y-STR гаплотипы обычно содержат от 12 до 111 маркеров, но оптимальный вариант по соотношению цена/качество считается 37 маркеров.

Пример Y67 гаплотипа: 13-23-15-10-11-14-12-12-12-13-29-17-9-9-11-11-25-15-19-29-15-15-16-17-11-12-21-14-16-16-18-9-10-11-12-12-15-16-16-17-17-8-10-10-11-11-11-12-22-20-13-14-17-17-19-11-12-23

Пример Y111 гаплотипа: 13-23-15-10-11-14-12-12-12-13-29-17-9-9-11-11-25-15-19-29-15-15-16-17-11-12-21-14-16-16-18-9-10-11-12-12-15-16-16-17-17-8-10-10-11-11-11-12-22-20-13-14-17-17-19-11-12-23-23-15-18-16-18-29-15-15-16-17-8-10-10-11-11-12-22-20-13-14-17-17-19-11-12-23-10-14-17-9-9-11

Как можно заметить, каждый Y-STR гаплотип является уникальным, так как определенное количество повторов Y-STR маркеров встречается у конкретного человека. Однако, Y-STR гаплотипы могут иметь сходства между собой у родственных людей, так как они могут унаследовать одинаковые генетические маркеры от общего предка.

Прочитать какими конкретно способами можно сравнивать Y-STR маркеры можно по ссылке Методика маркерного анализа — Circassian DNA — (aadna.ru)

Оставьте комментарий