Содержание
Онлайн-конференции «ДНК и история» — основы для понимания ДНК анализов можно получить по этому видео.
1. «Введение в генетику» — 00:03 Спикер: Александр Ракитько, директор по продукту Genotek. Александр Ракитько расскажет об основных генетических терминах простым языком: как устроен геном и что такое гаплогруппа, какие бывают ДНК-тесты на происхождение и как определяют этнический состав.
- Введение в мир днк тестов
- Термины и определения
- Гаплогруппа
- Методика маркерного анализа
- Подробнее о древе Yfull
- Чем отличаются тесты Y хромосомы?
- Часто задаваемые вопросы
Исследовано 37 маркеров в немецкой лаборатории YSEQ. В отличий от гораздо более дорого полногеномного теста, 37 маркерный тест позволяет только предсказать относительно глубокие линии гаплогрупп.
Описание начнем из далека, постепенно приближаясь с более современному периоду.
Все мужчины произошли от одного предка который жил более 200 тыс. лет назад. Цифра расчетная. Этого общего предка назвали оригинальным именем Адам. Он находится у основании Y-древа. В дальнейшем на Y-древе образовались много стволов. Это разные линии мужчин. Каждый из этих стволов можно получил свое номенклатурное название от A а до T.
У всех мужчин был общий предок. Это первый общий предок. Задача ДНК теста Y-хромосомы состоит в том, чтобы найти последнего общего предка.
По результатам теста выявлена гаплогруппа R1a. Все мужчины линии R1a потомки одного мужчины который жили ~ 18 тыс. лет назад. Это уже гораздо ближе, чем 200 тыс. лет, но все еще очень далеко от современности. За эти 18 тыс. лет потомки R1a разошлись по всеми миру, став одной из самых распространенных в мире гаплогрупп.
Если R1a мы условно считаем стволом древа, то можно сказать, что на этом стволе со временем образовалось огромной число новых линий. При этом подавляющее число этих линий относятся к R1a Z645. Z645это одна из ветвей R1a. Последовательность выглядит следующим образом:
Ниже перечислены все предковые линии Z645
Adam > A0-T > A1 > A1b > BT > CT > CF > F > GHIJK > HIJK > IJK > K > K2 > K2b > P > P-V1651 > P-M1254 > P-P337 > P-P284 > P-P226 > R > R-Y482 > R1 > R1a > M459 > M735 > M198 > M417 > Z645
Эти символы обозначают путь который прошли многие поколения мужчин. Начинается он у всех мужчин одинаково. Более 230 тыс. лет назад, с обозначения Adam. В правой части последняя запись Z645. Представители этой линии — потомки мужчины жившего 5000 лет назад.
Одно из основных предположений, что эта линия связано с Индо-Арийскими миграциями. Со временем потомки Z645 разделились на 2 крупные ветви. Одна из них преимущественно Азиатская, обозначается как Z93. Вторая чаще всего встречается в Восточной Европе, в первую очередь среди славян, потомков балтов, татар итд. Называется она Z283.
Примерная схема миграций R1a Z645
Все потомственные линии Z283 описать почти невозможно, мы состредочимся на той, что выявлена у Клименко. Самый глубокий прогнозируемый субклад (ветка на древе) — YP953.
Продолжим пусть начиная с R1a.
Z645 > Z283 > Z282 > Z280 > CTS1211 > Y2205 > Y35 > CTS3402 > YP237 > FGC13681 > YP953
Одна из самых крупных линий Z645 это субклад Z280. Ниже описана схема Z280. Предполагаемая линия Клименко отмечена как CTS1211
Карта распространения CTS1211 .
Возраст CTS1211 ~ 4500 лет.
Самое сложное, это спрогнозировать наиболее современную ветку. В нашем случае самая глубокая прогнозная линия YP953.
К сожалению по 37 маркерам определить из каких отмеченных цветами регионами могли быть предки Клименко невозможно. Если резюмировать, то можно сказать, что результаты Клименко относятся к одной из самых распространенных у славян линий.
Y-STR маркеры и Y-STR гаплотип
Основанием для прогноза являются цифры в таблице выше. Для непосвященного человека эти цифры ничего не значат. Этот код позволяет сравнивать результаты с тестами других мужчин. Обозначения над цифрами это название маркеров. Некоторые маркеры очень специфичные, по ним удается группировать мужчин. Для это используются инструменты описанные ниже.
Nevgen
Nevgen — это онлайн-сервис, который позволяет предсказать Y-хромосомную гаплогруппу и субклад на основе STR-маркеров (коротких тандемных повторов). Он особенно полезен для тех, кто еще не сделал глубокий SNP-тест Y-хромосомы (BigY или аналоги), но уже имеет результаты по STR-маркерам (например, 12, 37, 67 или 111 маркеров).
Анализ STR-маркеров в сервисе Nevgen позволяет предсказать положение конкретной линии на дереве Y-хромосомных гаплогрупп и оценить целесообразность более глубокого SNP-тестирования
Подробнее по ссылке в шапке — Методика маркерного анализа
STR Match Finder
Видеоинструкция к STR Match Finder
STR Match Finder — это еще один полезный онлайн-инструмент для ДНК-генеалогии, который позволяет находить близких родственников по мужской линии на основе сравнения STR-маркеров Y-хромосомы. Он особенно актуален для тех, кто еще не сделал глубокий SNP-тест (BigY или аналоги), но хочет найти потенциальных родственников среди протестированных из той же популяции или гаплогруппы.
Поиск STR-совпадений в базе STR Match Finder помогает найти потенциальных родственников по мужской линии среди других протестированных из той же популяции. Мерой близости при этом служит генетическая дистанция, зависящая от числа мутационных различий
Здесь надо в первую очередь обращать внимание на колонку GD. Чем меньше там цифра, тем более близкий результат (совпадают маркеры). В таблице отмечены отличающиеся маркеры. GD = 5 может означать как родство на уровне 3х тыс. лет, так и до 1000 лет.
Без CDY
Статистика проекта
По ссылке вы можете познакомится со статистикой. Сколько всего протестировано, информация по субэтносам, гаплогруппа итд.