Клименко

Онлайн-конференции «ДНК и история» — основы для понимания ДНК анализов можно получить по этому видео.

1. «Введение в генетику» — 00:03 Спикер: Александр Ракитько, директор по продукту Genotek. Александр Ракитько расскажет об основных генетических терминах простым языком: как устроен геном и что такое гаплогруппа, какие бывают ДНК-тесты на происхождение и как определяют этнический состав.

  1. Введение в мир днк тестов
  2. Термины и определения
  3. Гаплогруппа
  4. Методика маркерного анализа
  5. Подробнее о древе Yfull
  6. Чем отличаются тесты Y хромосомы?
  7. Часто задаваемые вопросы

Исследовано 37 маркеров в немецкой лаборатории YSEQ. В отличий от гораздо более дорого полногеномного теста, 37 маркерный тест позволяет только предсказать относительно глубокие линии гаплогрупп.

Описание начнем из далека, постепенно приближаясь с более современному периоду.

Все мужчины произошли от одного предка который жил более 200 тыс. лет назад. Цифра расчетная. Этого общего предка назвали оригинальным именем Адам. Он находится у основании Y-древа. В дальнейшем на Y-древе образовались много стволов. Это разные линии мужчин. Каждый из этих стволов можно получил свое номенклатурное название от A а до T.

yree
Клименко 13

У всех мужчин был общий предок. Это первый общий предок. Задача ДНК теста Y-хромосомы состоит в том, чтобы найти последнего общего предка.

По результатам теста выявлена гаплогруппа R1a. Все мужчины линии R1a потомки одного мужчины который жили ~ 18 тыс. лет назад. Это уже гораздо ближе, чем 200 тыс. лет, но все еще очень далеко от современности. За эти 18 тыс. лет потомки R1a разошлись по всеми миру, став одной из самых распространенных в мире гаплогрупп.

Если R1a мы условно считаем стволом древа, то можно сказать, что на этом стволе со временем образовалось огромной число новых линий. При этом подавляющее число этих линий относятся к R1a Z645. Z645это одна из ветвей R1a. Последовательность выглядит следующим образом:

Ниже перечислены все предковые линии Z645

Adam > A0-T > A1 > A1b > BT > CT > CF > F > GHIJK > HIJK > IJK > K > K2 > K2b > P > P-V1651 > P-M1254 > P-P337 > P-P284 > P-P226 > R > R-Y482 > R1 > R1a > M459 > M735 > M198 > M417 > Z645

Эти символы обозначают путь который прошли многие поколения мужчин. Начинается он у всех мужчин одинаково. Более 230 тыс. лет назад, с обозначения Adam. В правой части последняя запись Z645. Представители этой линии — потомки мужчины жившего 5000 лет назад.

image 30
Клименко 14

Одно из основных предположений, что эта линия связано с Индо-Арийскими миграциями. Со временем потомки Z645 разделились на 2 крупные ветви. Одна из них преимущественно Азиатская, обозначается как Z93. Вторая чаще всего встречается в Восточной Европе, в первую очередь среди славян, потомков балтов, татар итд. Называется она Z283.

Примерная схема миграций R1a Z645

image 32
Клименко 15

Все потомственные линии Z283 описать почти невозможно, мы состредочимся на той, что выявлена у Клименко. Самый глубокий прогнозируемый субклад (ветка на древе) — YP953.

Продолжим пусть начиная с R1a.

Z645 > Z283 > Z282 > Z280 > CTS1211 > Y2205 > Y35 > CTS3402 > YP237 > FGC13681 > YP953

Одна из самых крупных линий Z645 это субклад Z280. Ниже описана схема Z280. Предполагаемая линия Клименко отмечена как CTS1211

image 34
Клименко 16

Карта распространения CTS1211 .

image 33
Клименко 17

Возраст CTS1211 ~ 4500 лет.

image 35
Клименко 18

Самое сложное, это спрогнозировать наиболее современную ветку. В нашем случае самая глубокая прогнозная линия YP953.

image 36
Клименко 19

К сожалению по 37 маркерам определить из каких отмеченных цветами регионами могли быть предки Клименко невозможно. Если резюмировать, то можно сказать, что результаты Клименко относятся к одной из самых распространенных у славян линий.

Y-STR маркеры и Y-STR гаплотип

image 31
Клименко 20

Основанием для прогноза являются цифры в таблице выше. Для непосвященного человека эти цифры ничего не значат. Этот код позволяет сравнивать результаты с тестами других мужчин. Обозначения над цифрами это название маркеров. Некоторые маркеры очень специфичные, по ним удается группировать мужчин. Для это используются инструменты описанные ниже.

Nevgen

Nevgen это сервис который предсказывает гаплогруппы по набору маркеров. Подробнее по ссылке в шапке — Методика маркерного анализа

image 38
Клименко 21

STR Match Finder

Видеоинструкция к STR Match Finder

С теми у кого нет глубоких тестов оценить потенциальное родство можно при помощи более простых маркерных тестов.

Для тех кто поленился посмотреть видео поясняем, что на картинках ниже оценивается схожесть значений маркеров Y-хромосомы. Основное на что надо обращать внимание это цифра в столбце GD, что означает генетическая дистанция. Чем меньше цифра, чем вероятнее близкое родство. При сравнении 12 маркеров чаще всего стоит рассматривать только тех, у кого не более 1 го отличия. Часто бывает, что даже если есть полное совпадение по 12 маркерам, реальное родство на уровне многих тысяч лет.

Чем больше маркеров сравнивается, тем точнее результаты. При сопоставлении 37 маркеров близкими будут те, с кем различаются до 3-4 маркеров. Бывают и исключения.

Также стоит смотреть на то, какие именно маркеры отличаются. Чем маркер расположен правее, тем он подвержен более быстрой мутации. Иногда полезно смотреть совпадения без учета быстрых маркеров, особенно самого быстрого маркера — CDY.

image 35
Клименко 22

Здесь надо в первую очередь обращать внимание на колонку GD. Чем меньше там цифра, тем более близкий результат (совпадают маркеры). В таблице отмечены отличающиеся маркеры. GD = 5 может означать как родство на уровне 3х тыс. лет, так и до 1000 лет.

Без CDY

image 36
Клименко 23

Статистика проекта


По ссылке вы можете познакомится со статистикой. Сколько всего протестировано, информация по субэтносам, гаплогруппа итд.


Оставьте комментарий