Как заказать ДНК тест? Большое значение имеет выбор типа ДНК теста и лаборатории, в которой вы будете тестироваться. В основном мы будем рассматривать иностранные варианты, в виду их гораздо меньшей стоимости.
Начнем с самого продвинутого теста, полногеномного. Этот вариант включает все существующие виды тестов.
Выбор полногеномного теста
Основные критерии выбора — стоимость и качество. В 2022 году добавились проблемы с логистикой и оплатой, теперь мы вынуждены учитывать и эти факторы.
Качественные характеристики полногеномных тестов у всех рассматриваемых сегодня лабораторий совпадают. Длина прочтения 150 bs. Глубина прочтения 30x (или 90 гигабаз).
Длина прочтения это размер мельчайшей частички которую прочитывает секвенатор. Чем он больше тем лучше. Секвенатор целиком ни может прочитать наш геном, а лишь считывает наши ДНК маленькими частичками. Затем с помощью специальных программы мы собираем геном длиной в 3 млрд позиций. Эта гигантская последовательность из 3 млрд сложена из кусочков все по 150 позиций! Соответственно чем из больших частичек мы собираем геном, тем больше шансов сделать это правильно. В хромосомах есть повторяющиеся участки и порой невозможно из таких участков собрать правильные данные. Можно привести пример пазла. У каждого кусочка свое место. Чем большего размера размел кусочков, тем легче собрать. А если размер будет маленьким, то многие кусочки будут повторяться и непонятно в какой место их поставить.
Глубина прочтения тоже очень важная характеристика. В идеале секвенатору надо всего один раз пройтись и все наши данные будут прочитаны. Но при считывании не все частички «попадаются под руку». Возникают пропуски. Для надежности надо прочитать еще раз. Тогда возможно те места которые были пропущены в первый раз прочтутся. Некоторые места прочтутся второй раз, а некоторые прочитанные в первый раз, на этот раз не попадутся. Чем больше таких проходов, тем лучше. 30x означает 30 проходов. Где будет 40+, где 15, в среднем 30. Это достаточная цифра, хотя есть и x100 вариант полного генома.
Все варианты полногеномных тестов мы рассматривать не будем, только лишь те, что уже проверены и доступны к заказу. Например Китайские лаборатории предлагают хорошие цены, однако купить тест у них почти невозможно (проблемы с Китайской таможней).
YSEQ
По совокупности всех этих характеристик лучшим решением является немецкая лаборатория YSEQ. Из всех представленных у них на сайте вариантов ДНК тестов наиболее оптимальным решением является WGS+ стоимостью 400$. По цене YSEQ не лучшее решение. Цена у них стабильно держится на одном уровне. Скидок у них нет.
По качеству характеристики аналогичны тем, что предлагают конкуренты.
YSEQ выигрывает по логистике и вариантам оплаты. Большой плюс YSEQ в том, что они принимают щетки купленные локально. Не надо ждать пока приедет набор, а это экономит время. Плюс другие лаборатории не высылают в РФ (надо пользоваться посредниками). Вот вариант качественных щеток.
Второй существенный плюс YSEQ — варианты оплаты. Оплатить их услуги можно через крипто платеж и с недавних пор рублями через Yfull.
Nebula Genomics
Американская компания Nebula Genomics отличается качеством тестов. У них никогда не было проблем с качеством. Минус в том, что у них скрытые расходы на подписку. Стандартная стоимость тестов — 300$. Добавим сюда 75$ за подписку на 3 месяца (минимальный возможный период). Оплатить Российскими картами нельзя, надо искать тех кто поможет. Доставка до РФ тоже напрямую невозможна, нужны посредники.
Периодически бывают скидки до 200$ (275$ вместе с подпиской). При такой цене вариант можно считать хорошим, если вы найдете как оплатить.
Dante Labs
Dante Labs это Итальянская лаборатория с подмоченной репутацией. Ранее они не раз попадали в скандальные истории, в том числе связанные с тестами на ковид. Что касается полногеномных тестов, то ключевые к ним претензии касались проблем с доставкой в РФ, временем на выдачу результатов и качеством. Были случаи с плохим качество тестов. К настоящему времени отрицательных отзывов все меньше. Однако стоит учитывать возможные проблемы. Их продукты интересны только в период больших скидок. Как раз в августе 2022 г. у них объявлены скидки. Стоимость полного генома — 200 евро. Правда вам надо решать проблемы с оплатой. Однако у них тоже есть возможность оплаты криптовалютой. Вопрос с доставкой решается также как и Nebula Genomics и с FTDNA. Об этом в следующем разделе.
Решение проблем с доставкой
Вопрос доставки решить не сложно, достаточно воспользоваться одним из сервисов посредников. Один из самых популярных вариантов — Бандеролька. Вся необходимая информация есть на сервисе. После регистрации вам выдадут адрес который вы укажете на сайте, где нет доставки до РФ. Заказ придет на склад Бандерольки. После всех оформлений они вышлют вам посылку.
Аутосомные тесты
Аутосомные тесты можно покупать и в РФ. Компания Генотек вполне конкурентоспособна на этом попроще. Благодаря умному решению разрешить почти бесплатно загружать тесты из других лабораторий в свою базу, Генотек значительно расширился. С другой стороны многим не нравится, что совпадающие участки у Генотек всегда меньшего размера чем у конкурентов.
Если у вас полный геном, то отдельный тест заказывать не нужно. Аутосомы можно выделить из полного генома. Для это вам потребуется замечательная программа WGSExtract.
Аутосомные тесты FTDNA и Myheritage также можно заказать через бандерольку. Дополнительно придется решать проблемы с оплатой.
Все эти 3 сайта отличаются тем, что разрешают загрузку чужих аутосомных файлов. Следующие 2 других крупных игрока на этом рынке такого не позволяют.
23andme и Ancestry. Заказ набора на этих сайтах и до санкций был проблематичен, однако это все же возможно. Наборы можно купить на торговых площадка, либо заказать через посредников, родственников итд. Минус этих баз в том, что они в основном рассчитаны на западный мир. Для РФ во много раз актуальнее базы FTDNA, Myheritage и Genotek.
Тесты Y хромосомы
Чем отличаются тесты Y хромосомы?
Как уже было сказано выше, самый полный вариант ДНК теста — полногеномный тест. Такой тест охватывает до 99% всех ваших ДНК. Продвинутые тесты Y хромосомы дают возможность рассчитать время жизни общих предков по мужской линии с другими протестированными такими же глубокими тестами. Кроме полногеномных тестов к продвинутым тестам Y хромосомы относится BigY тест от FTDNA.
Минус BigY в том, что это продукт нацеленный только на Y хромосому, которая составляет всего 2% от ДНК мужчин. Даже более того, BigY охватывает всего 80% от этих 2%. Почти в 100 раз меньше чем полный геном. При этом стоимость 380$+ (в период максимальных скидок). И еще минус, FTDNA заставляют платить 100$ сверху за выкуп Bam файла. Это исходники, которые содержат всю информацию по вашему тесту. И без этого Bam файла данные можно загрузить на Yfull, чтобы посчитать все возраста, однако результаты могут иногда отличаться.
Есть у FTDNA BigY и плюсы. Первый, самый рекламируемый, это база совпадений. Действительно у FTDNA большая база совпадений по Y хромосоме, как по маркерам, так и по полным тестам (FTDNA Block Tree). Однако система совпадений FTDNA не очень удобная. Использование сервиса STR Match Finder дает гораздо больше информации. Подробнее по ссылке.
Второй плюс FTDNA BigY это Y-STR маркеры. В этот продукт гарантированно входит набор из 111 самых важных маркеров. Полногеномные тесты не дадут такой набор. В лучшем случае 80-90% от этого набора получается извлечь из полного генома. Но такой ли это существенный минус? Те маркеры который получится выделить из полного генома уже достаточны для поиска совпадений по маркерам. Плюс к тому же, маркерные совпадений не столь надежный инструмент, приоритет за снипами. На самом деле при поиске маркерных совпадений не имеет особого смысла сравнивать больше чем 37 маркеров. Такой продукт стоит в YSEQ 85$. FTDNA по скидкам продают такой набор от 89$, чаще всего цена ближе к 120$.
Дополнительный плюс полного генома в том, что это продукт который будет совершенствоваться в будущем. По мере выхода новых версий референсного генома мы можем пересобрать полный геном на новый вариант. BigY таким похвастаться не может, это одноразовый продукт. Области которые будут появляться в новых версиях референса будут вам недоступны, если у вас BigY.
Плюс мы еще ничего не сказали про митохондриальную гаплогруппу. Полный геном и здесь на высоте. В иных случаях надо отдельно заказывать полный мито тест +- 150$.
Теперь все понятно)